Gabedit

Software screenshot:
Gabedit
Dettagli del software:
Versione: 2.4.0
Data di caricamento: 11 May 15
Sviluppatore: Allouche abdul-Rahman
Licenza: Libero
Popolarità: 105

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

Gabedit è una Graphical User Interface per gaussiana, Molcas, Molpro e MPQC pacchetti di chimica computazionale.
 
 Gabedit include servizi grafici per la generazione di parole chiave e le opzioni, le specifiche molecole e ther sezioni di ingresso anche per i tipi di calcolo più avanzati Gabedit include un costruttore Molecule avanzata.
 
 Si può usare per disegnare rapidamente in molecole e esaminarli in tre dimensioni. È possibile creare molecole di atomo, l'anello, gruppo, aminoacidi e nucleosidi. È anche possibile leggere la geometria da un file. La maggior parte dei principali formati di file molecolare sono supportati.
 
 Gabedit include una finestra di installazione Calcolo gaussiana, Molcas, Molpro e MPQC che consente di impostare i lavori di Gauss, Molcas, Molpro e MPQC in modo semplice e diretto.
 
 Gabedit include un editor di testo per la modifica Molcas, Molpro, file di input gaussiana e MPQC.
 
 Gabedit può visualizzare graficamente una varietà di gaussiana, Molcas, Molpro, MPQC e (parzialmente) i risultati dei calcoli ADF, tra cui:
 
 ย ท orbitali molecolari.
 ย ท Superfici dalla densità elettronica, potenziale elettrostatico, NMR densità di schermatura, e altre proprietà.
 ย ท superfici possono essere visualizzati in modalità a rete solida, traslucide e filo.
 ย ท superfici possono essere colorati da una proprietà separata.
 ย ท Contours (codificati per colore).
 ย ท Planes (codificati per colore).
 ย ท Dipole
 ย ท assi XYZ e gli assi principali della molecola.
 ย ท Animazione dei modi normali corrispondenti alle frequenze vibrazionali.
 ย ท animazione della rotazione della geometria, superficiale, dipolo, xyz e gli assi principali della molecola.
 ย ท Animazione di contorni.
 ย ท Animazione di aerei codificati per colore.
 
 Gabedit può visualizzare IR e Raman calcolati spettri. Gabedit può generare un file povray per geometria (atomi + obbligazioni, legame di idrogeno), superfici (comprese le superfici codificati per colore), contorni, aerei codificati per colore.
 
 Gabedit può salvare un'immagine in PPM, BMP, (JPEG) e formato PS. Gabedit può generare automaticamente una serie di immagini per l'animazione (vibrazione, la geometria della convergenza, la rotazione, contorni, gli aerei codificati per colore)

Cosa c'è di nuovo in questa versione:

  • Piccoli bug sono stati corretti.
  • NWChem è ora supportato.
  • I giochi nativi per Windows è ora supportato.

Cosa c'è di nuovo nella versione 2.3.5:.

  • sono stati fissati bug minori
  • Gli atomi possono essere fissati nel corso di una simulazione dinamica molecolare.
  • Migrazione da Cairo a OpenGL per disegnare la finestra geometria.
  • Migrazione da gtkglarea a GtkGLExt.
  • Parallelizzazione con OpenMP.

Cosa c'è di nuovo nella versione 2.3.0:.

  • sono stati fissati bug minori
  • L'utente può leggere gli orbitali, della geometria e modi normali da un file gaussiana fchk.
  • Si può leggere gli orbitali del nuovo formato di file aux Mopac (compreso il formato compresso).
  • Diverse nuove opzioni nelle finestre XYPlot e ContoursPlot (testo inserto, linee, frecce, immagini, nuovi temi ...).
  • Le lunghezze delle obbligazioni possono essere fissati nel corso di una simulazione MD.
  • ottimizzazione parziale è ora possibile con il potenziale MM.
  • L'attuazione di uno strumento per prevedere le masse e abbondanze degli isotopi per una data molecola. Realizzazione di uno strumento per calcolare la suscettibilità elettrofile, nucleofili e radicali per una molecola.

Cosa c'è di nuovo nella versione 2.2.0:

  • Piccoli bug sono stati fissati
  • Tutte le modifiche geometriche può essere annullata e rifatta utilizzando il Undo e Redo (u / U o Ctrl z / Ctrl y)
  • L'utente ha il controllo completo sui titoli visualizzati in un disegno.
  • Il disegno dell'atomo molecola per atomo sono state semplificate.
  • Il disegno del frammento per frammento molecola sono state semplificate.
  • Gabedit leggere connettività da gabedit, hin, pdb, mol2 e file mol.
  • L'utente può impostare il valore della distanza, angolo di legame e angolo diedro.
  • Una dinamica molecolare ricerca conformazionale è implementata con un potenziale MM (Ambra 99).
  • Una dinamica molecolare ricerca conformazionale è implementata utilizzando un metodo semi-empirico (da Open Mopac o PCGamess).
  • Migrazione da funzioni di disegno GDK a Cairo:. Cross-dispositivo di rendering per la grafica vettoriale
  • Il Cairo è ora utilizzato per il widget XYplot gabedit (usato da gabedit per spettri sorteggio).
  • Il Cairo è ora utilizzato per la finestra di disegno geometrico.
  • La geometria può essere esportato in eps, PS, PDF o file in formato SVG.
  • Le curve della finestra XYplot possono essere esportati in eps, PS, PDF o file in formato SVG.
  • Nuovo strumento per la distanza di calcolo tra i 2 punti sulla finestra XYPlot. & Quot; Ctrl + tasto shift & quot; può essere utilizzato per fare uno zoom sulla finestra XYPlot.
  • La nuova versione di PCGamess (Firefly) è ora supportato

Cosa c'è di nuovo nella versione 2.1.13:

  • bug minori sono stati fixe
  • Una dinamica molecolare ricerca conformazionale è implementata con un potenziale MM (Ambra 99).
  • Una dinamica molecolare ricerca conformazionale è implementata con un potenziale semi-empirici (utilizzando MOPAC o PCGamess).
  • Si può ottimizzare la geometria in modo interattivo usando il metodo MOPAC o PCGamess semi-empirica, dalla finestra Geometria Draw
  • Migrazione da funzioni di disegno GDK a Cairo: Cross-dispositivo di rendering per la grafica vettoriale. Cairo è ora utilizzato per il widget XYplot gabedit (usato da gabedit per spettri sorteggio). Cairo è ora utilizzato per la finestra di disegno geometrico.
  • La geometria può essere esportato in eps, PS, PDF o file in formato SVG. Le curve di finestra XYplot possono essere esportati in eps, PS, PDF o file in formato SVG.
  • Nuovo strumento per la distanza di calcolo tra i 2 punti sulla finestra XYPlot. & Quot; Controllo pulsante & quot + sinistra; può essere utilizzato per fare uno zoom sulla finestra XYPlot.
  • La nuova versione di PC Gamess / Firefly è ora supportato

Requisiti

  • gtk +

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