CLC DNA Workbench

Software screenshot:
CLC DNA Workbench
Dettagli del software:
Versione: 5.0
Data di caricamento: 2 Jun 15
Sviluppatore: CLC bio A/S
Licenza: Shareware
Prezzo: 80.00 $
Popolarità: 21

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

CLC DNA Workbench crea un ambiente software che permette agli utenti di effettuare un gran numero di sequenza del DNA avanzate analisi, combinata con la gestione dei dati liscio, ed eccellenti opzioni di visualizzazione e di output grafico.
CLC DNA Workbench è disponibile su Windows, Mac OS X, e Linux

Caratteristiche .

  • Bioinformatica dispone Gene Workbench :
  • visualizzazione flessibile di molecole circolari.
  • Editor per la progettazione grafica di fondo e algoritmicamente avanzato
  • Assemblea dei dati della sequenza del DNA
  • La clonazione molecolare
  • automatico SNP annotazione di sequenze
  • Ricerca e la scoperta di modelli di DNA
  • analizza regione complessità locale
  • traduzione Reverse dalle proteine ​​a gene, sulla base di tabelle di traduzione da un certo numero di specie
  • Avanzate analisi e gestione enzima di restrizione
  • Dot analisi basate trama
  • forma breve le statistiche di DNA, tra cui un certo numero di caratteristiche di una data molecola
  • NCBI ricerca dei dati di sequenza
  • L'accesso alle informazioni web da PubMed
  • Altre caratteristiche bioinformatica:
  • DNA, RNA e editor di sequenza della proteina visualizzando sia molecole lineari e circolari
  • DNA, RNA e proteine ​​alignment editor
  • loghi interattivi lungo entrambi i tracciati di DNA, RNA e proteine ​​
  • Elaborazione batch di analisi su sequenze multiple in un unico lavoro-passo
  • Ricerca Motif
  • Pattern discovery (modelli sconosciuti)

  • Opzione di allineamento
  • Avanzate riallineamento e fissare punti
  • Sequenza logo grafici lungo DNA, RNA e proteine ​​allineamenti
  • annotazione manuale di sequenze
  • Ricerche integrato PubMed
  • Ricerca sequenza basata sul Web utilizzando BLAST
  • Dot analisi basate trama
  • analizza regione complessità locale e trame complessità
  • grafici frazione Gap
  • G / C analisi dei contenuti e grafici
  • Progetto e gestione dei dati:
  • La piena integrazione dei dati di input, la gestione dei dati, risultati di calcolo, e l'esportazione di dati
  • dettagliata registro cronologico
  • Tutti i tipi di file possono essere salvati in progetti locali, e ha lanciato dal programma
  • Importazione ed esportazione di dati in un gran numero di formati di file
  • Possibilità di lavorare in diverse aree di lavoro attive alla volta, consentendo il lavoro simultaneo su più progetti
  • Importa di file di dati di traccia ei punteggi di qualità di macchine sequening DNA automatizzati con Chromatogram standard formato, formati ABI e il formato PHD (Phred)
  • Visualizzazione e reporting:
  • vista BLAST Avanzate
  • grafici Visualizzazione avanzata
  • visualizzazione a istogramma Avanzate
  • Avanzate vista dot plot
  • Cerca caratteristiche in sequenze e allineamenti

Requisiti

  • 256 MB di RAM
  • 512 MB di RAM consigliati
  • 1024 x 768 schermo raccomandato

Limitazioni

  • demo di 4 settimane completamente funzionale

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