misopy

Software screenshot:
misopy
Dettagli del software:
Versione: 0.4.9
Data di caricamento: 20 Feb 15
Sviluppatore: Yarden Katz
Licenza: Libero
Popolarità: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO (Miscela delle isoforme) è un framework probabilistico scritto in Python che quantifica il livello di espressione & nbsp; di geni splicing alternativo da dati RNA-Seq, e identifica le isoforme differentemente regolamentati o esoni tra campioni.
Modellando il processo mediante il quale legge generativa sono prodotte da isoforme di RNA-Seq, il modello MISO utilizza bayesiana per calcolare la probabilità che una lettura originato da un particolare isoforma.
MISO utilizza l'assegnazione dedotto di legge per isoforme per quantificare le abbondanze del set base di isoforme di mRNA alternative. Gli intervalli di confidenza oltre le stime possono essere ottenute, che quantificano l'affidabilità delle stime.
Si prega di consultare il manuale per http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ MISO e la documentazione

Requisiti :.

  • Python

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