CLC Sequence Viewer crea un ambiente di software che permette agli utenti di effettuare un gran numero di bioinformatica analisi, combinata con la gestione dei dati liscia, ed eccellenti opzioni di visualizzazione e output grafico.
Cosa c'è di nuovo in questo rilasciare:
Nuove funzionalità e miglioramenti
-
Tutte le comunicazioni del server NCBI è ora crittografato. (NCBI si trasferirà tutti i servizi Web per il protocollo HTTPS il 30 settembre 2016). & Nbsp;
-
L'elenco degli enzimi preinstallati nel workbench & nbsp; è stato aggiornato dalla rebase.
-
lo strumento di avvio veloce si trova ora sotto il menu degli strumenti al posto del menu Visualizza e un pulsante chiamato di lancio che porta in primo piano questo strumento è stato aggiunto alla barra degli strumenti.
- L'opzione "non è nella lista" è stato introdotto come una nuova opzione di filtro tavolo.
-
Il "Sort cartella" strumento utilizza ora l'ordinamento numerico per i nomi dei file preceduto da un numero.
- I nuovi segnaposti sono disponibili quando si definiscono i nomi delle uscite esportatore: & nbsp; {User}, & nbsp; {host}, e per gli elementi del timestamp dell'oggetto uscita, {anno}, & nbsp; {mese}, & nbsp; {giorno}, & nbsp; {ora, & nbsp; {minuto}, & nbsp; . {secondo} & nbsp;
- I segnaposto all'interno di nomi di uscita di esportazione che in precedenza erano disponibili solo come le cifre possono essere specificati utilizzando nomi scritti: {input} è sinonimo di {1}, {estensione} è un sinonimo per {2} e {contatore} è sinonimo di {3}.
-
GenBank importazione consente ora anche per i nomi di file con estensione 'GBFF'.
-
Leggi dettagli del gruppo sono ora mostrati sulla vista Elemento Info di liste di sequenza.
-
Risolto un problema raro in cui alcune annotazioni potrebbe , ma non necessariamente, andare dispersi in & nbsp; sequenze con più di 1000 annotazioni di un determinato tipo su quella sequenza prima della cancellazione e in cui è stata utilizzata l'opzione del menu contestuale del tasto destro "Cancella selezione". & nbsp;
-
Corretto un bug nella procedura guidata "Manage enzimi" che ha impedito a un utente di annullare l'azione se "Salvo nuova lista enzima" è stato attivato.
-
Risolto un problema con lo strumento di importazione di metadati in cui, se un foglio di calcolo era già stato caricato, quindi selezionando di nuovo lo stesso foglio di calcolo non ricaricare il contenuto di foglio di calcolo.
-
Risolto un problema in cui ci è voluto molto tempo per aprire un banco di lavoro che era & nbsp; previouslyclosed quando si visualizza un editor tavolo aperto che erano stati ordinati. & nbsp;
-
Risolto un problema in cui tasto destro del mouse su un grafico in un report e scegliendo di mostrare "report", "storia" o "Element Info" ha innescato un errore.
- Varie correzioni di bug minori .
Cosa c'è di nuovo nella versione 7.7:
- Tutti i fogli Excel in un documento vengono importate e ogni foglio ha una tabella creata per i suoi contenuti.
- Il CSV, HTML e Excel tavolo / tabellare esportatore ora utilizzare "Inf "e" nan "valori per sostituire l'ambiguo"? ".
- nella procedura guidata per l'esportazione di una tabella in formato CSV, quando non l'esportazione di tutte le colonne, è ora possibile cancellare o tornare alla precedente passo mentre le colonne selezionate stanno caricando. & nbsp;
- impostazioni di stampa stesso può ora essere applicate per più report in un unico esportazione. & nbsp;
- La "Gestione Risorse" scheda è stata rimossa dal . la Gestione Plugin
Cosa c'è di nuovo nella versione 7.6.1:
Correzioni di bug
- Risolto un problema in cui alcune operazioni di filtraggio, come ad esempio "non contiene" non hanno agito correttamente quando si filtrano le celle di tabella che contenevano più pezzi di informazioni.
- fissi un problema in cui le annotazioni che attraversava le estremità di una sequenza circolare sarebbero stati collocati in modo non corretto nella circolare Sequence View.
- Risoluzione di un errore che ha causato il banco di lavoro per bloccare se alcune sequenze sono state visualizzate in vista circolare con il rendering radiale etichette.
- Risolto un problema in cui alcune operazioni di filtraggio, come ad esempio "non contiene" non ha agito correttamente quando si filtrano le celle di tabella che contenevano più pezzi di informazioni.
- Risolto un problema che impedivano una cartella principale di Windows su unità da essere usato come un percorso di file.
- Risolto un problema per cui l'aggiornamento di un impianto esistente su Windows si tradurrebbe nel file .vmoptions essere cancellati, il che rende la corsa Workbench con il . configurazione di default di Java
Cosa c'è di nuovo nella versione 7.6:
Nuove funzionalità e miglioramenti
- Un 3D Molecule Viewer è ora disponibile per la visualizzazione di proteine, RNA, DNA, e piccole molecole.
- Migliorata la segnalazione di errori relativi allo spazio su disco insufficiente.
- Corretto il problema con i collegamenti e il testo in tabelle che erano stati tagliati fuori quando successo un collegamento
- analisi sito di restrizione:. I valori di "Cut posizione (s) "colonna della tabella di analisi sito di restrizione ora si comporta come i numeri al posto del testo, il che significa ordinamento e filtraggio opere.
-
Un problema con le impostazioni della tabella salvati che a volte non ha funzionato è stato risolto. Il bug fix comprende un modo più robusto / generico di salvataggio delle impostazioni della tabella con colonne diverse. Per risolvere questo problema, tovaglie salvate esistenti devono prima essere caricati su un oggetto in cui opera (cioè ha le stesse colonne come quando è stato salvato); e poi le impostazioni della tabella devono essere salvati con il vecchio nome per sovrascrivere le impostazioni & nbsp;
-
I metadati per gli alberi filogenetici:. Un errore è stato corretto & nbsp; con l'importazione di colonna di metadati contenente nomi con i due punti.
- Corretto errore quando mostra le traduzioni delle annotazioni più brevi di 3 basi di proteine.
Cosa c'è di nuovo nella versione 7.5:.
- I "Flussi di lavoro" non utilizzati pulsante è stato rimosso dalla barra degli strumenti
- Ricerca locale attivato dalla barra dei menu ora include il filtraggio su "Path".
- Filtro avanzato sulle tavole ora include la possibilità di filtrare per uno spazio, virgola o semi-colon elenchi delimitati di termini.
- strumenti Zoom riprogettazione:. La Zoom funzione di selezione è ora disponibile anche per le sequenze, elenchi di sequenza, allineamenti, e leggere le mappature
- Salvataggio / applicazione delle impostazioni lato del pannello per le tabelle ora lavora per diverse tabelle che condividere alcune colonne. & nbsp;.
-
le operazioni di copia può ora essere fermato
-
Importa dell'esempio dei dati e le importazioni effettuate tramite i file trascinandoli nella Workbench e rilasciandoli nel riquadro di spostamento non sarà più bloccare l'interfaccia utente durante l'esecuzione. Invece, l'importazione avviene come un processo in background che può essere monitorato e controllato tramite la scheda Processi nell'angolo in basso a sinistra.
- banchi da lavoro CLC ora supportano display ad alta risoluzione come Apple Retina display di tutti i dati mostrati nell'area di visualizzazione (compresi i suggerimenti).
- denominazione più informativo di regione codificante traduzioni prodotte dallo strumento Traduci proteine. Il nome di traduzione regione codificante consiste nel nome della sequenza di input seguito dal tipo di annotazione e infine il nome dell'annotazione.
I commenti non trovato