Serial Cloner

Serial Cloner è un software di biologia molecolare. Fornisce strumenti con un'interfaccia intuitiva che aiuta nella clonazione di DNA, analisi di sequenza e la visualizzazione. Serial Cloner è stato sviluppato per fornire un software di biologia molecolare della luce sia per gli utenti Macintosh e Windows. Serial Cloner legge e scrivere Strider DNA (tm) di file compatibili e file di importazione e di esportazione nel formato FASTA universale (come pure in formato pDRAW32). Potenti strumenti di visualizzazione grafica e interfacce semplici aiutano le fasi di analisi e di costruzione (adattatore, PCR, Gateway [tm] clonazione) in modo molto intuitivo. La versione 1.3 aggiunge ora un cutter virtuale, un browser Web con l'importazione istantanea di voci NCBI / EMBL e una restrizione mappa silenzioso insieme ad altri miglioramenti.

Cosa c'è di nuovo in questa versione:

• [NEW] Stime punto isoelettrico di sequenze proteiche (DNA e proteine ​​sequenza finestra)
• version [NEW] MacOSX ora distribuito come applicazione firmata (compatibilità Mountain Lion Gatekeeper)
• [AGGIUNTO] Una opzione nelle Preferenze per selezionare le tabelle valore di chiave da utilizzare per la stima pI
• [AGGIUNTO] Una opzione nelle Preferenze di utilizzare il codice Codone dalle tabelle di utilizzo Codone come codice genetico utilizzato per la traduzione
• [AGGIUNTO] Un'opzione nella finestra restrizione mappa solo di tradurre nucleotidi che sono in maiuscolo
• [AGGIUNTO] Un pulsante / menu per scegliere i siti specifici da visualizzare nelle mappe di restrizione.
• [AGGIUNTO] Scansione Caratteristiche peptidi in sequenze proteiche
• [AGGIUNTO] Eredita Caratteristiche quando reverse tradurre una sequenza di DNA
• [AGGIUNTO] un rapido passaggio tra DNA e proteine ​​finestra Allinea
• [AGGIUNTO] non formattato copia della sequenza di proteine ​​(Copia More ... Menu)
• [AGGIUNTO] Eredita Caratteristiche caso di sequenze di copia / incolla Proteine ​​
• [AGGIUNTO] Funzioni schermo a Protein Align (Allinea locale)
• [AGGIUNTO] Un pulsante di attivazione per evidenziare le differenze nelle proteine ​​allineati
• [AGGIUNTO] Una scorciatoia (S) per visualizzare rapidamente o Caratteristiche maschera (nella scheda Caratteristiche di Sequence Windows)
• [AGGIUNTO] 'Anchor' e domini 'core' di primer sono ormai riconosciuti come funzionalità in sequenza di Windows
• [AGGIUNTO] Un pulsante per selezionare rapidamente un inserto lineare, completa nella finestra 'Costruire un Construct'
• [AGGIUNTO] Aggiunto un collegamento a 'Copia non formattato' [Comando-Maiuscole-K]
• [AGGIUNTO] Una voce di menu per andare a Serial Cloner Forum
• [AGGIUNTO] Una voce di menu per andare a Serial Cloner Youtube Channel (tutorial)
• [AGGIORNATO] Ora è possibile ridimensionare le finestre completamente Sequenza
• [Aggiornamento] siti Assente sono indicati in corsivo in windows Chooser enzimi (grafiche e restrizione Maps)
• [Aggiornamento] siti unici sono indicati in grassetto nella finestra Chooser enzimi (grafiche e restrizione Maps)
• [AGGIORNATO] Parsing di sequenze NCBI (Web Access) per prendere in considerazione i cambiamenti nelle pagine NCBI.
• [AGGIORNATO] Migliorata analisi di sequenze contenenti 'X' nella sequenza nucleotidica
• [AGGIORNATO] scorciatoia Cambiato di 'Copy Tutti sequenze MultiFASTA' a [Comando-Maiuscole-J] anziché [COMMAND-SHIFT-K]
• [CORRETTO] Un bug dell'interfaccia di Windows specifica la finestra 'Importa Codone Bias'
• [CORRETTO] Un bug talvolta impedendo una corretta copia di immagini (mappa grafica, Cut virtuale, shRNA) nella clipboard (Windows specifico)
• [CORRETTO] Un problema derivante con nomi RE non comuni come R1.BceSIV in particolare enzima "chooser della mappa grafica.
• [CORRETTO] Un problema [Gateway Clonazione] con l'indicazione caratteristiche in cui il vettore destinazione era antisenso (ATT2-ATT1 direzione)
• [CORRETTO] Un bug nella selezione della AA più usata per la traduzione inversa
• [CORRETTO] Un problema con "Seleziona tutto" in sequenza e Proteine ​​finestre
• [CORRETTO] Un problema di tipo di file associato al file Serial Cloner (rottura compatibilità con l'importazione Sequencher in particolare)
• [CORRETTO] Legatura: A volte inutilmente prodotto degenere DNA
• [CORRETTO] Gateway: DNA generato ma poi quando poi salvato tipo sconosciuto
• [CORRETTO] PCR:. Se fatto su "formato sconosciuto" sequenza, tipo generato in modo errato "Protein"
• [CORRETTO] Un problema di aggiornamento Feature quando annullare una modifica
• [CORRETTO] Quando si incolla una sequenza proteica in formato GenBank (NCBI) una finestra sequenza proteica è stato creato correttamente.
• [CORRETTO] Un problema con il server BLAST NCBI quando si utilizzano caratteri non ASCII nei nomi di sequenza
• [CORRETTO] Un problema con display Feature dopo una scansione, quando è stato trovato solo una caratteristica
• [CORRETTO] Un raro problema di visualizzazione delle funzioni nella finestra Construct
• [CORRETTO] Un problema di aggiornamento quando si utilizzano caratteri diversi da 12 pt in mappe grafiche.
• [CORRETTO] Un bug nella restrizione mappa finestre dove la prima linea della traduzione aminoacido è stato spostato in modalità codone
• [CORRETTO] Un bug relativo prevenire l'uso di enzimi precedentemente selezionati nel Virtual Window Cutter