strumento a riga di comando per il confronto virgola delimitato i file di dati con differenze rispetto per determinare le conformazioni più simili. Compsort confronta i file di dati utilizzando differenza relativa, calcola un punteggio di somiglianza, ordina i punteggi in ordine crescente (valori più bassi rappresentano maggiore similarità), consente di risparmiare un numero X di punteggi bassi.
I file di dati prodotti dall'utente, devono essere da virgole file di testo delimitato. Ogni file rappresenta una molecola unica. Ogni riga in un file rappresenta una conformazione unica della molecola. La prima colonna del file di dati deve essere un'etichetta unica per la conformazione rappresentata dalla fila. Il resto delle colonne sono descrittori numerici, come le misurazioni dello spazio di distanza.
Le righe vengono confrontati combinatorio tra i file. Le etichette in confronto sono concatenati e salvate con i punteggi per l'insieme di righe. Questo fornisce un modo per identificare le conformazioni che hanno prodotto un determinato punteggio di somiglianza.
Il lavoro futuro comprende:
- aggiungendo un'interfaccia GUI
- la pubblicazione di carta sul mio algoritmo modellazione farmacoforo 3D
- Una versione parallela utilizzando MPI
Cosa c'è di nuovo in questa versione:
- fissa un paio di minore avvisi del compilatore
- aggiunto segnalazione del tempo di calcolo per l'insieme di calcoli combinatori oltre al tempo di tipo precedentemente riportato
- aumento del livello di ottimizzazione del compilatore del binario
Requisiti :
Mac OS X 10.3
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