InterMine

InterMine fornisce le routine di accesso al datawarehouse basati sulla tecnologia InterMine.
InterMine è un potente sistema di data warehouse open source. Utilizzando InterMine, è possibile creare database di dati biologici a cui si accede da sofisticati strumenti di query web. Parser sono previste per l'integrazione di dati da diversi formati biologiche comuni e non vi è un framework per aggiungere i propri dati. InterMine include un attraente, interfaccia web user-friendly che funziona 'out of the box' e può essere facilmente personalizzato per le vostre esigenze specifiche.
Tutto il codice InterMine è liberamente disponibile sotto la licenza LGPL

Cosa c'è di nuovo in questa versione:.

• Collegamento per InterMine:
• Ci sono diversi nuovi modi per collegare nella vostra miniera. Vedere i link per i dettagli.
• servizio Web formati JSON:
• Ci sono diversi nuovi risultati webservice formati. Partecipare jsonobjects apparsi in 0.95, ora abbiamo formato JSON per quasi tutto il resto:
• Risultati:
• jsonrows - rappresentazione tabellare di dati con metadati aggiuntivi
• & quot; jsontable & quot; . - Formato contenitore per la creazione di modelli integrati (vedi: imbedding tutorial)
• & quot; count & quot; e & quot; jsoncount & quot; - Formati per ricevere solo il conteggio di una query
• Webservice meta-dati (modello e modelli):
• & quot; JSON & quot; - Versioni facilmente analizzabili del modello dati e all'elenco dei modelli disponibili
• Autenticazione Ora Lavorare in Perl Webservice Cliente:
• Gli utenti del client Perl Webservice hanno ora accesso programmatico ai loro elenchi e modelli privati. Basta fornire la password per il client per accedere al tuo conto (i dati sono trasmessi in formato criptato). Questa caratteristica funziona con tutte le miniere di webservices, non solo quelli a 0.96 e superiori.
• Risultati di oggetti con i Clienti Webservice:
• I clienti Perl e Java sono in grado di ottenere risultati indietro come oggetti (JSON oggetti, o in Perl, gonfiati fino a oggetti pieni risultato). Questo semplifica alcuni problemi di elaborazione dati complessi, e si occupano di outer join e collezioni.
• Tabelle integrate:
• È ora possibile incorporare nativamente le tabelle di dati da qualsiasi miniera con un webservice di supporto nelle vostre pagine web con JavaScript e CSS. Vedere il tutorial imbedding per una dimostrazione e una introduzione a questa tecnica. Assicurati di giocare con la nuova libreria JavaScript disponibili presso http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registro:
• Abbiamo lanciato un servizio di registrazione centrale per implementazioni InterMine. Questo non solo fungere da & quot; Giallo-pagine & quot ;, permettendo ai visitatori di scoprire nuove fonti di dati, e facilitare l'interoperabilità tra le miniere stesse, ma supporta anche i webservices, fornendo un registro di URL webservice e versioni. Visita del Registro di sistema http://www.intermine.org/registry, e per aiutare a registrare il proprio miniera, visitare il sito RegisteringYourMine.
• LINK reindirizzamenti:
• È possibile aggiungere una proprietà di avere collegamenti nei risultati pagine reindirizzano a qualsiasi URL. Vedere LinkRedirects per ulteriori informazioni.

Contenuti
• Home page:
• La home page per InterMine può ora essere configurato per visualizzare informazioni differenti in base a se l'utente è nuovo. Vedere HomepageConfig per le istruzioni su come configurare questo comportamento.
• Nuovo tag:
• Abbiamo aggiunto un nuovo tag: im: admin. Se si etichetta un modello con im: admin, non verrà visualizzato nella vostra webapp. Ciò è utile per nascondere i modelli necessari webservices di InterMine dagli utenti. Vedere Tagging per un elenco di tutti i tag disponibili.
• Elenco di upload:
• Il processo di caricamento lista è stata migliorata.
• Altre modifiche:
• UPDATE - più rigoroso correzione verifica di ipotesi multiple sui widget di arricchimento. & Quot; Numero di prove & quot; è ora il numero di termini associati con la lista di riferimento.
• UPDATE - opzioni di filtro più utili su widgets arricchimento
• NEW - Holm-Bonferroni opzione aggiunta di widget arricchimento
• UPDATE - nuovo & quot; eliminare & quot; pulsante sulla pagina liste
• UPDATE - interazioni displayer caricato tramite AJAX così segnalare caricamento della pagina più veloce
• FIX - & quot; score & quot; visualizzazione delle immagini correttamente nei risultati di ricerca
• UPDATE - QueryBuilder più interattiva, la selezione di un elemento nella lista si torna alla voce originale dopo pagina di aggiornamento / reload
• UPDATE - link inserito in sintesi colonna nei risultati dell'interrogazione, fare è più facile da visualizzare i valori distinti
• FIX - login bug relativo username caso misto
• FIX - widget di bug quando si visualizzano dopo l'esportazione dei dati di widget
• NEW - query template sono in ordine di popolarità, a meno che non si è connessi, nel qual caso sono ordinate per data ogni query era ultima corsa
• FIX - i dati non si ripete in & quot; quot varie &; alle pagine del report
• FIX - modelli visualizzati correttamente sulla pagina del rapporto anche per le sottoclassi
• FIX - modelli il rendering corretto delle pagine di formato
• UPDATE - aggiornato convertitore BIOGRID per gestire le modifiche nei file di dati più recenti
• FIX - vari & quot; oro & quot; CSS tema e le immagini migliorati e aggiornati
• FIX - problema di sicurezza filo affrontata nel template monitoraggio
• UPDATE - widgets tabella può gruppo da un attributo e classe

Requisiti :

• Python