GenoSuite è un framework sviluppato per l'analisi proteogenomic. Strategia basata FDRScore viene utilizzato per integrare i risultati provenienti da più algoritmi di ricerca. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) è sviluppato come parte integrante del quadro GenoSuite. PPT è per la ricerca di nuove traduzioni in genomi procarioti e dipende dai dati di proteomica basati spettrometria di massa e sequenza del genoma relativa. Le caratteristiche includono configurati per 4 algoritmi open source per l'esecuzione del database alla ricerca per l'identificazione di peptidi e qualsiasi combinazione dell'algoritmo 4 può essere scelto, elenca i peptidi specifici di ricerca del genoma (peptidi romanzo), incontri spettrali possono essere visualizzati per la valutazione della qualità, elenca fuori le nuove proteine e modifiche delle annotazioni proteine esistenti, e un contesto genomico visiva dei nuovi peptidi possono anche essere generati.
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