WaveSorter sottolinea visualizzazione dinamica e versatilità. Cursori consentono all'utente di selezionare qualsiasi coefficiente o campione da una delle numerose trasformazioni, che possono poi essere tracciati ad uno degli assi di un istogramma 2D (dispersione). Nello spazio della forma d'onda, i controlli basati sul cursore permette di selezionare sottoregioni dello spazio forma d'onda o singole forme d'onda per visualizzare. L'utente può raggruppare le forme d'onda manualmente o tramite uno dei numerosi programmi di clustering popolari. La classificazione con le proprietà delle forme d'onda può essere salvato su disco in semplici file di testo. WaveSorter è scritto in C ++, utilizza la Biblioteca Scientifica GNU per tutti i calcoli, ed è altamente parallelizzato. Su hardware moderno in grado di gestire file contenenti diversi 100,000s di forme d'onda per canale con quasi nessuna evidente perdita di GUI fluidità e 1.000.000 forme d'onda per canale. Può essere eseguito in modalità batch. Supporta una vasta gamma di formati di file binari e di testo ASCII.
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