Deve avere Bioinformatica Per Linux
ProteinShop è uno strumento interattivo per la manipolazione di strutture proteiche. E 'stato progettato per creare rapidamente un insieme di configurazioni di proteine con la conoscenza umana e l'intuizione. Queste configurazioni possono essere...
pyNetConv è una libreria Python creato per aiutare la conversione di alcuni formati di file di rete.A partire dalla versione 0.6, pyNetConv è in grado di lettura / scrittura (e convertire da / a) i seguenti formati di...
Pysam è un modulo Python per la lettura e la manipolazione Samfiles & nbsp;. E 'un involucro leggero del samtools C-API.La guida rapida è qui. Documentazione più dettagliata è disponibile qui.Domande e commenti sono benvenuti e devono essere inviate...
PySCeS è un progetto sviluppato da Triple-J Gruppo Molecular Cell Physiology. & Nbsp; per cercare modelli e comprendere i complessi processi e dei sistemi che costituiscono la cellula vivente Caratteristiche :. Un testo basato descrizione modello...
reciprocal_smallest_distance è un algoritmo ortologia coppie che utilizza l'allineamento di sequenze globale e di massima verosimiglianza distanza evolutiva tra sequenze rileva con precisione ortologhi tra genomi. Installazione da un tarball Scaricare...
RFLP Planner è uno strumento che aiuta a pianificare un esperimento RFLP: Essa constata enzimi di restrizione che tagliano una serie di omologhi sequenze di DNA in modi diversi e simula l'immagine gel-elettroforesi risultante. Il programma ti aiuta a...
Seal è un modulo Python che fornisce allineamento di sequenze su Hadoop.Seal è una di MapReduce domanda di allineamento di sequenza biologica. Funziona su Hadoop (http://hadoop.apache.org) attraverso Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), una API Python...
seriesoftubes è una pipeline estesa per Solexa dati ChIP-Seq.Documentazione Package
Requisiti :
...
Costruire sistemi come make sono spesso utilizzati per creare flussi di lavoro complessi, ad esempio, in bioinformatica. & nbsp; snakemake mira a ridurre la complessità dei flussi di lavoro creando, fornendo un linguaggio pulito e moderno dominio...
SSuMMo è una libreria di funzioni progettate intorno iterativo utilizzando HMMER per assegnare le sequenze di taxa. & Nbsp; I risultati sono alberi molto annotati mostrano specie / distribuzione genere all'interno di quella comunità.I programmi...