Bio-Linux

Bio-Linux è un sistema operativo open source basato sul mondo e rsquo; s più popolare distribuzione gratuita di Linux, Ubuntu, costruita intorno al moderno ambiente Unity Desktop, e progettato da zero per essere utilizzato da bioinformaticians.Distributed come singolo, doppio arco live DVDThe distro può essere scaricato dal Softoware come singolo, a doppio arco in diretta le immagini DVD ISO di circa 3 GB di dimensione, che supporta sia a 64-bit (x86_64) e 32-bit (i386) architetture dei set di istruzioni. Si deve essere distribuito a uno un flash drive USB o DVD per l'avvio dal BIOS di un optionsBeing computer.Boot basata su Ubuntu, è dotato di un boot loader identico, progettato per consentire di provare il sistema operativo senza installare nulla , avviare direttamente il programma di installazione, testare la RAM per errori, l'avvio dal primo disco, così come per controllare l'integrità del supporto avviabile (solo se si utilizza un supporto DVD) .Modern e ambiente desktop produttivo alimentato da UnityAs menzionati, la distribuzione & rsquo ; s predefinito e solo ambiente desktop è l'unità, che utilizza un layout del pannello / dock. Mentre il pannello, che si trova nella parte superiore dello schermo, è perfetto per interagire con i programmi in esecuzione, il dock vi aiuterà a lanciare rapidamente il vostro preferito applications.Some dei migliori bioinformatica open source appsSome delle migliori applicazioni di bioinformatica open source sono inclusi in questo sistema operativo basato su Ubuntu, tra i quali possiamo citare Act, Arb, Cn3D, Cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, ClustalX, Dendroscope, DDV Sequence Viewer Alignment, Entrez, Eqtl, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, GGobi, ISACreator, Re, LRmapqtl, mesquite e Jemboss.Bottom lineSumming up, Bio-Linux è un sistema operativo molto veloce e produttivo basato sulla più recente versione di Ubuntu upstream e con l'ambiente desktop GNOME Classic, così come alcuni dei migliori applicazioni bioinformatiche open source

Cosa c'è di nuovo in questa versione:.

• Risolve un problema di recente con il desktop non aver per iniziare su VirtualBox causa di driver incompatibili.
• Aggiornamenti vari pacchetti, in particolare QIIME e Bowtie-Bio strumenti.
• Aggiunge il pandaseq abbinato fine assembler.
• Aggiunge i principianti aggiornati specifico tutorial a Bio-Linux 8.

Cosa c'è di nuovo nella versione 8.0.2:

• Nuovo Ubuntu 14.04 sistema di base supporta l'hardware più recente e fornisce up-to-date software per ufficio, multimedia, etc.
• Le versioni aggiornate delle applicazioni di bioinformatica chiave come QIIME, Mothur, jalview, Artemis, BLAST, strumenti Bowtie-Bio e molti altri (utenti che non l'aggiornamento non sarà più ricevere gli aggiornamenti).
• Up-to-date versioni di molti pacchetti R, tra cui ggplot2, DESeq e edger più aggiornato Bioconductor e di altri pacchetti disponibili per l'installazione diretta via C2D4U.
• Fornitura di modelli pre-preparati per l'uso su VMWare / VirtualBox.
• La sostituzione di NX con x2go, una versione più flessibile del sistema di remote-desktop veloce e sicuro.
• L'inclusione del desktop MATE come alternativa leggera a Unity.
• Una confezione più robusta di Galaxy, con il supporto per il caricamento strumenti strumento-capannone, procura Apache, automatizzato PostgreSQL set-up, autenticazione per gli account locali e upload di file SFTP.
• Un gattino gratuito con ogni download!
• ... ok, forse ho mentito riguardo il gattino, ma abbiamo alcuni splendidi nuovi sfondi presentate dalla comunità di utenti - vedi sotto
.

Cosa c'è di nuovo nella versione 7.0.3:

• Bio-Linux 7 è completamente caratterizzata, potente , configurabile e facile da mantenere bioinformatica workstation. Bio-Linux fornisce più di 500 programmi di bioinformatica su una Ubuntu Linux 12.04 LTS base. C'è un menu grafico per i programmi di bioinformatica, oltre a un facile accesso al sistema di documentazione bioinformatica Bio-Linux e dati di esempio utile per programmi di test.
• Bio-Linux 7 aggiunge numerosi miglioramenti rispetto alle versioni precedenti, tra cui l'ambiente di analisi Galaxy. Ci sono anche diversi pacchetti per gestire i tipi di dati di sequenza di nuova generazione.
• È possibile installare Bio-Linux sulla vostra macchina, sia come unico sistema operativo, o come parte di una configurazione dual-boot che consente di utilizzare il sistema attuale e Bio-Linux sullo stesso hardware.
• Bio-Linux gestisce anche in diretta dal DVD o una chiavetta USB. Questo viene eseguito in memoria della vostra macchina e non comporta installare nulla. Questo è un grande, senza problemi modo per provare Bio-Linux, dimostrare o insegnare con essa, o per lavorare con quando si è in movimento.
• Bio-Linux è costruita su sistemi open source e software, e quindi è libero di installare e utilizzare.