progetto SIGINT è uno strumento software da riga di comando che può essere utilizzato per trovare e classificare le proteine di mammiferi / geni che specificamente e significativamente interagiscono con un elenco di proteine / geni in un contesto di uno sfondo signalome mammiferi e reti interactoma.
Gli ingressi al programma sono: (a) un elenco di semi di simboli gene Entrez gene umano, (b) una rete, sfondo in formato SIG, e (c) un nome per il file di output (pagina web il nome del file con l'estensione htm ). SIGINT genera un elenco ordinato di geni / proteine che interagiscono con i componenti della lista seme. Questi componenti sono ordinati da un punteggio z che misura la specificità di questi componenti intermedi per interagire con i geni / proteine dall'elenco seme.
SIGINT può essere eseguito su sistemi operativi Linux, Mac e Windows e richiede uno sfondo file di testo della rete in formato SIG.
Uso:
Estrarre l'archivio
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
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