progetto Adun è un programma di simulazione biomolecolare estensibile che include funzionalità di gestione e analisi dei dati.Adun offre algoritmi avanzati e protocolli per la simulazione molecolare che si può accedere da un'interfaccia utente...
MacMolPlt è un programma di grafica moderna per la stampa strutture molecolari 3-D e modi normali (vibrazioni). I moderni...
massXpert pacchetto spettrometria di massa è un ambiente spettrometria di massa per (bio) polimeri lineare. Eredita tutte le innovazioni di polyxmass GNU, in quanto è un porto di quel progetto di un ambiente di sviluppo cross-platform Cosa c'è di...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) è un programma efficiente che allinea sequenze nucleotidiche relativamente brevi nei confronti di una sequenza di riferimento lungo come il genoma umano.Il software implementa due algoritmi, BWA-breve e BWA-SW. I precedenti...
ghiozzo è una API Python per la lettura di file di dati binari creata usando il quadro di gestione dei dati Goby next-gen.Normalmente, questa directory si presenta come parte del pacchetto ghiozzo completo, disponibile a partire da:& Nbsp; http:...
MACS2 è uno strumento di analisi del modello base per i dati Chip-Seq.Con il miglioramento delle tecniche di sequenziamento, cromatina immunoprecipitazione seguita da alta sequenziamento rendimento (ChIP-Seq) sta diventando popolare per studiare le...
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Il progetto Steme ha iniziato la vita come approssimazione per l'algoritmo Expectation-Massimizzazione per il tipo di modello utilizzato in cercatori motivi quali MEME.Steme & rsquo; s EM approssimazione eseguito un ordine di grandezza più velocemente...
SyntenyMiner è un'applicazione che permette di visualizzare e interrogare il confronto tra più sequenze genomiche complete. L'interfaccia fornisce una visione navigabile di partite per una sequenza di riferimento del genoma. Sequenza corrisponde...
NetAtlas è un plugin Cytoscape che utilizza dati di espressione genica dei tessuti di filtrare rete di segnalazione cellulare. NetAtlas identifica delle reti di tessuto-definiti, componenti di rete tessuto-specifici e componenti con l'espressione...
