Costruire sistemi come make sono spesso utilizzati per creare flussi di lavoro complessi, ad esempio, in bioinformatica. & nbsp; snakemake mira a ridurre la complessità dei flussi di lavoro creando, fornendo un linguaggio pulito e moderno dominio...
CLC DNA Workbench crea un ambiente software che permette agli utenti di effettuare un gran numero di sequenza del DNA avanzate analisi, combinata con la gestione dei dati liscio, ed eccellenti opzioni di visualizzazione e di output grafico.CLC DNA...
seriesoftubes è una pipeline estesa per Solexa dati ChIP-Seq.Documentazione Package Requisiti : ...
Il progetto Steme ha iniziato la vita come approssimazione per l'algoritmo Expectation-Massimizzazione per il tipo di modello utilizzato in cercatori motivi quali MEME.Steme & rsquo; s EM approssimazione eseguito un ordine di grandezza più velocemente...
Genepidgin è una suite di strumenti Python che assistono in nomi di prodotto di valutazione e di assegnazione dei geni & nbsp; Ci sono tre componenti principali.:genepidgin * pulito *& Nbsp; standardizza i nomi dei geni per le linee guida di denominazione...
MISO (Miscela delle isoforme) è un framework probabilistico scritto in Python che quantifica il livello di espressione & nbsp; di geni splicing alternativo da dati RNA-Seq, e identifica le isoforme differentemente regolamentati o esoni tra...
Pathomx (ex MetaPath) è un software di grafica open source realizzato in IPython, Qt e PyQt, progettato dalla terra fino a agire come un programma di utilità interattivo per la visualizzazione e l'analisi dei dati metabolici sotto GNU / Linux e altri...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) è un programma efficiente che allinea sequenze nucleotidiche relativamente brevi nei confronti di una sequenza di riferimento lungo come il genoma umano.Il software implementa due algoritmi, BWA-breve e BWA-SW. I precedenti...
avalanchetoolbox è uno strumento per identificare e descrivere i processi di ramificazione, come valanghe neuronali Requisiti :. ...
OpenElectrophy è un quadro per facilitare la manipolazione, lo stoccaggio e l'analisi dei dati elettrofisiologici. E 'possibile importare i dati da qualsiasi formato e memorizzarli in un unico database SQL-tipo.Strumenti di analisi inclusi in...
