MetagenomeDB è una libreria Python progettato per memorizzare facilmente, recuperare e annotare le sequenze metagenomiche. & Nbsp; MetagenomeDB agire come un livello di astrazione in cima ad un database MongoDB. Esso fornisce una API per creare e...
SSuMMo è una libreria di funzioni progettate intorno iterativo utilizzando HMMER per assegnare le sequenze di taxa. & Nbsp; I risultati sono alberi molto annotati mostrano specie / distribuzione genere all'interno di quella comunità.I programmi...
tigreBrowser è un gene espressione modello di browser risultati di pacchetto R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installazione: tigreBrowser richiede Python versione> = 2.5. tigreBrowser può essere installato con...
MACS2 è uno strumento di analisi del modello base per i dati Chip-Seq.Con il miglioramento delle tecniche di sequenziamento, cromatina immunoprecipitazione seguita da alta sequenziamento rendimento (ChIP-Seq) sta diventando popolare per studiare le...
edittag è una collezione un'applicazione per la progettazione di insiemi di modificare i tag sequenze metriche, controllando sequence tags per conformazione alla modifica metrica, e integrare i tag sequenza di adattatori sequenziamento specifiche...
MacMolPlt è un programma di grafica moderna per la stampa strutture molecolari 3-D e modi normali (vibrazioni). I moderni...
PicMe è un pacchetto Python che contiene i programmi di stimare e tracciare informatività filogenetica per grandi insiemi di dati. Installazione Per il momento, il modo più semplice per installare il programma è il seguente:git clone git:...
SyntenyMiner è un'applicazione che permette di visualizzare e interrogare il confronto tra più sequenze genomiche complete. L'interfaccia fornisce una visione navigabile di partite per una sequenza di riferimento del genoma. Sequenza corrisponde...
ProteinShop è uno strumento interattivo per la manipolazione di strutture proteiche. E 'stato progettato per creare rapidamente un insieme di configurazioni di proteine con la conoscenza umana e l'intuizione. Queste configurazioni possono essere...
PySCeS è un progetto sviluppato da Triple-J Gruppo Molecular Cell Physiology. & Nbsp; per cercare modelli e comprendere i complessi processi e dei sistemi che costituiscono la cellula vivente Caratteristiche :. Un testo basato descrizione modello...
