Seal è un modulo Python che fornisce allineamento di sequenze su Hadoop.Seal è una di MapReduce domanda di allineamento di sequenza biologica. Funziona su Hadoop (http://hadoop.apache.org) attraverso Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), una API Python...
TRMiner è una utility Python che mira a curatori di dati scientifici. & Nbsp; Permette di potare rapidamente grandi collezioni di pubblicazioni scientifiche a pene rilevanti per un determinato obiettivo minerario.Ciò si ottiene in due fasi. In primo...
Pysam è un modulo Python per la lettura e la manipolazione Samfiles & nbsp;. E 'un involucro leggero del samtools C-API.La guida rapida è qui. Documentazione più dettagliata è disponibile qui.Domande e commenti sono benvenuti e devono essere inviate...
PySCeS è un progetto sviluppato da Triple-J Gruppo Molecular Cell Physiology. & Nbsp; per cercare modelli e comprendere i complessi processi e dei sistemi che costituiscono la cellula vivente Caratteristiche :. Un testo basato descrizione modello...
ghiozzo è una API Python per la lettura di file di dati binari creata usando il quadro di gestione dei dati Goby next-gen.Normalmente, questa directory si presenta come parte del pacchetto ghiozzo completo, disponibile a partire da:& Nbsp; http:...
SSuMMo è una libreria di funzioni progettate intorno iterativo utilizzando HMMER per assegnare le sequenze di taxa. & Nbsp; I risultati sono alberi molto annotati mostrano specie / distribuzione genere all'interno di quella comunità.I programmi...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) è un programma efficiente che allinea sequenze nucleotidiche relativamente brevi nei confronti di una sequenza di riferimento lungo come il genoma umano.Il software implementa due algoritmi, BWA-breve e BWA-SW. I precedenti...
La torba è una suite di programmi per la cattura, prevedere e analizzare le caratteristiche biofisiche di proteine.Per la documentazione, istruzioni, screenshot ecc Vedi http://enzyme.ucd.ie/PEAT Requisiti :. ...
OpenElectrophy è un quadro per facilitare la manipolazione, lo stoccaggio e l'analisi dei dati elettrofisiologici. E 'possibile importare i dati da qualsiasi formato e memorizzarli in un unico database SQL-tipo.Strumenti di analisi inclusi in...
NEO (Neural Ensemble Objects) ed è un progetto per fornire un insieme comune di classi di base da utilizzare in analisi dei dati neurali, con l'obiettivo di ottenere OpenElectrophy, NeuroTools e forse altri progetti con obiettivi simili più...
