STEPS è un pacchetto per la simulazione stocastica esatto di sistemi di reazione-diffusione in geometrie 3D complesse arbitrariamente. L'algoritmo di simulazione nucleo è un'implementazione di SSA di Gillespie, esteso per affrontare diffusione...
tapiro è uno strumento Python che contiene i programmi di stimare e tracciare informatività filogenetica per grandi insiemi di dati. Citando tapiro Quando si utilizza il tapiro, si prega di citare:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapiro abilita alte...
PicMe è un pacchetto Python che contiene i programmi di stimare e tracciare informatività filogenetica per grandi insiemi di dati. Installazione Per il momento, il modo più semplice per installare il programma è il seguente:git clone git:...
tigreBrowser è un gene espressione modello di browser risultati di pacchetto R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installazione: tigreBrowser richiede Python versione> = 2.5. tigreBrowser può essere installato con...
checkmyclones è un software che fornisce gli strumenti per verificare sequenziamento Sanger risultati. & Nbsp; (o qualsiasi file FASTQ testo normale o) contro una serie di sequenze di riferimento, a condizione che in qualsiasi formato ragionevole...
Syntainia è un'applicazione innovativa per la visualizzazione di più genomi. & Nbsp; Presenta un'interfaccia semplice e intuitiva per visualizzare e manipolare le relazioni tra gruppi di geni. Con una visualizzazione più chiara gene, è più facile...
CWC Simulator è un C ++ implementazione di CWC, un calcolo per la rappresentazione e simulazione di sistemi biologici. & Nbsp; Al termine dell'installazione (vedi INSTALL) sarete in grado di eseguire simulazioni più modelli CWC, come mostrato in...
AREM si basa su un MACS (Model Based Analysis per i dati ChIP-Seq).High-throughput sequencing accoppiato ad cromatina precipitazione immunoterapia (ChIP-Seq) è ampiamente usato nella caratterizzazione del genoma a livello schemi vincolanti fattori di...
AHREA è una suite di sofware che fa l'individuazione Espressione relativa discenti facile. . E 'scritto in Python Requisiti ...
sistema E-Cell è un concetto di costruzione di cellule virtuali sui computer.Sistema di E-Cell è una suite di software object-oriented per la modellazione, la simulazione e l'analisi di sistemi complessi su larga scala, come le cellule biologiche,...
